Cerita dimulai dengan ancaman terhadap gubernur Tokyo, tapi berpikir cepat Conan mencegah setiap kematian ketika sebuah terowongan kereta bawah tanah diledakkan. Conan belajar mungkin ada sambungan ke sebuah desa yang direlokasi untuk pembangunan bendungan, dan dia ras untuk menghentikan kriminal sebelum serangan berikutnya.
