Terletak di dunia yang sedikit futuristik dimana Bumi telah diserang dan berperang dengan alien dari dimensi lain yang disebut Nova, ceritanya mengikuti petualangan seorang anak Jepang bernama Kazuya Aoi yang mendaftar untuk pelatihan di sekolah khusus untuk rekayasa genetik perempuan yang disebut Pandoras yang bertempur dengan alien, dan mitra laki-laki mereka, yang disebut Limiters, yang menggunakan kekuatan khusus yang disebut “Freezing” untuk membatasi mobilitas lawan mereka.
Protagonis membuat perkenalan seorang gadis yang lebih tua yang tidak biasa bernama Bridgette L. Satellizer yang tampaknya menjadi Pandora paling kuat di kelasnya, tetapi belum memilih pasangan pria untuk menjadi Limiter untuk dirinya, dan meskipun peringatan dari semua teman-temannya , ia memutuskan untuk menjadikan dia Limiter.