Di masa depan Smart Brain nyaris mewujudkan ambisinya karena 90% populasi bumi telah dihuni oleh ras jenis baru bernama Orphnoch sedangkan ras manusia diambang kepunahan. Takumi Inui sang Kamen Rider Faiz yang diharapkan menjadi penyelamat umat manusiapun dinyatakan hilang setelah diserang Riotrooper, pasukan elit milik Smart Brain. Sejak kejadian itu Mari Sonoda, sahabat Takumi, membentuk kelompok pemberontak bersama dengan manusia lain yang masih tersisa. Mereka menyerang markas Smart Brain guna merebut “Emperor Belt”, sebuah proyek rahasia yang konon berupa rider gear baru yang sangat kuat. Sayangnya usaha mereka gagal.