Alfred Izuruha, yang berusia 10 tahun tinggal di sebuah koloni di Side 6 dan, seperti kebanyakan anak laki-laki seusianya, yang terobsesi dengan perang antara Federasi Bumi dan Zeon. Tanpa sepengetahuan dia, tetangga sebelahnya, Christina adalah seorang Pilot test untuk prototype Gundam yang dibuat Federasi Bumi di Koloni. Sebuah tim pasukan khusus Zeon ditugaskan untuk menyelinap dan mencuri atau menghancurkannya.
Ketika pertempuran pecah antara Federasi Bumi dan Pasukan Zeon yang menyusup. Alfred bertemu dengan seorang pilot rockie Zaku, Bernard “Bernie” Wiseman. Setelah pertemuan itu, keduanya menjadi bersahabat, sehingga Alfred dapat mempelajari perang yang begitu menarik baginya, dan Bernie dapat menarik informasi yang penting bagi timnya.
