Sinopsis dari film ini menyangkut wabah potensial dari Perang Besar Dunia Ninja Keempat ketika ninja dengan kemampuan Kekkei genkai mulai menghilang dari Kumogakure, Iwagakure, Kirigakure, dan Sunagakure. Konohagakure masih satu-satunya desa tidak terpengaruh oleh peristiwa , orang mulai mencurigai perannya dalam insiden ini, dan rumor dari pemberontakan yang mungkin mulai beredar. Dengan mengumpulkan bangsa tentara di perbatasan Negeri Api dan invasi mengancam lainnya , Feodal Lord Negeri Api memerintahkan Tsunade untuk menangkap pelaku sesungguhnya dan membuktikan konoha tidak bersalah, dalam hal kegagalan, Negeri Api akan dipaksa untuk menghancurkan desa untuk menjaga perdamaian dunia.
