Kei Nagai meninggal dalam kecelakaan lalu lintas, tetapi tubuhnya beregenerasi dan dia bangkit. Berdasarkan kecelakaan itu, dia sadar bahwa dirinya adalah Ajin. Ajin adalah makhluk yang dianggap berbahaya oleh manusia. Kemudian, Kei pun ditangkap pemerintah dan dikirim ke laboratorium penelitian. Di sana, dia mengalami berbagai percobaan yang menyiksa. Lalu, datanglah Satou, yang merupakan Ajin sekaligus teroris untuk membantu Kei. Namun, Kei menolak ajakannya karena Satou ingin melakukan genosida pada manusia.
