Semua orang di dunia menggunakan aplikasi smartphone. Tapi di dalam mereka mengintai makhluk tak dikenal yang disebut “Appli Monsters,” atau “Appmon.” The Appmon adalah AI lifeforms dengan kemampuan untuk berpikir dan bertindak, dan ada di batas antara dunia manusia dan ruang digital. Di laut yang luas dari internet, “bos terakhir AI” Leviathan mengambil kendali dari Appmon dengan virus dan mulai peretasan setiap sistem, sehingga mulai mengendalikan dunia manusia dari dunia internet. Haru Shinkai dipimpin untuk memperoleh Appli Drive, dan menggunakannya untuk terwujud Gatchmon, sebuah rakasa aplikasi pencarian.
