Di Ikkitousen, wilayah Kanto di Jepang terkunci di tengah peperangan antara tujuh sekolah menengah yang berbeda. Di antara siswa sekolah ini adalah beberapa orang terpilih yang memiliki manik-manik suci. Magatama ini menyimpan jiwa para pejuang yang bertempur selama Era Tiga Kerajaan China. Tidak hanya para siswa ini diberkati dengan kemampuan yang menarik dari jiwa mereka terikat, tapi juga diberkati, atau mungkin dikutuk, dengan nasib para pejuang ini dari masa lalu.
Salah satu siswa ini adalah Hakufu Sonsaku; seorang gadis muda yang peduli dan cengeng yang baru saja pindah ke Akademi Nanyo dan akan tinggal dengan sepupunya, Koukin Shuyu. Kedatangan Hakufu menciptakan ketegangan yang hampir langsung karena kekuatannya sebagai pejuang dan kemungkinan dia adalah orang yang membawa semangat panglima perang China, Sun Ce. Pejuang paling kuat di Nanyo, yang dikenal sebagai “The Big Four” terguncang oleh kehadirannya dan bertekad menghentikan Hakufu untuk mencapai tujuan yang diberikan kepadanya oleh ibunya: untuk menaklukkan orang-orang yang menantangnya dan mempersatukan ketujuh sekolah tersebut.
