Profesor Hershel Layton, arkeolog terkenal dan muridnya Luke Triton menerima surat misterius dari mantan muridnya Janice Quatlane yang berisi tiket untuk opera di Crown Petone. Namun ternyata acara itu bukan opera biasa tapi sebuah game rumit yang mempertaruhkan kehidupan.
Profesor Layton bersama muridnya Triton berusaha untuk memecahkan teka-teki tersebut!