Berlatar di Tokyo Modern yang mengisahkan petualangan sekelompok remaja yang berbeda-beda yang menyebut diri mereka “Phantom Thieves of Hearts.” Bersama dengan kemampuan supernatural mereka yang disebut sebagai Persona, kelompok mereka berusaha untuk menyelesaikan kejahatan dengan mereformasi korupsi yang ada di hati orang-orang.