Cerita mengenai Seto no Hanayome bercerita mengenai seorang anak laki laki bernama Nagasumi Michishio. Suatu hari di saat liburan musim panas tepatnya di pantai Seto, Nagasumi diselamatkan saat tengelam di laut oleh seorang putri duyung yang bernama Sun Seto. Dalam hukum putri duyung, bagaimanapun jika identitas seorang putri duyung diketahui harus dieksekusi, atau orang yang mengetahuinya harus dieksekusi. Untuk menyelamatkan hidup keduanya Nagasumi dan Sun, Keluarga Sun, yang merupakan kepala komplotan mafia, memutuskan keduanya untuk dinikahkan. Ayah Sun Gōzaburō sangat marah dengan pernikahan putrinya yang mendadak. Nagasumi berusaha beradaptasi dengan kehidupan pernikahannya yang sangat sulit.
