Suatu hari, sebuah kota mendadak lenyap. Takuya, seorang penyelundup profesional bertemu dengan Yuki, satu-satunya orang yang selamat dari reruntuhan kota. Dengan bermodalkan surat yang ditinggalkan oleh ayah Yuki, mereka menuju kota yang sekarang dikenal dengan nama Lost. Akan tetapi, sebuah kelompok misterius yang bergerak dalam bayangan telah menanti mereka.