Selamat datang di dunia Gensokyo yang menarik, di mana youkai (sebutan untuk semua makhluk halus), hewan dan beberapa manusia hidup, benar-benar terpisah dari dunia kita oleh penghalang magis. Satu-satunya gerbang antara dua dunia adalah kuil Hakurei. Reimu Hakurei adalah gadis yang bekerja di kuil tersebut. Setiap kali masalah supernatural (dikenal sebagai “Insiden”) terjadi, Reimu pergi dengan teman-temannya untuk menyelidiki, menghilangkan penyebabnya dan membantu mengembalikan Gensokyo ke keseimbangannya.
