Pada tahun 298 dari era para dewa, gadis sekolah dasar Sumi Washio, Sonoko Nogi, dan Gin Minowa bertugas dengan misi penting. Mereka menjadi pahlawan dan melawan Vertex, musuh misterius yang menyerang Shinju-sama, pohon tuhan yang melindungi Shikoku, satu-satunya wilayah di dunia yang masih layak huni. Apa yang tidak mereka ketahui, adalah bahwa pertarungan ini mempertaruhkan hal yang besar dari yang bisa mereka bayangkan.